De Raad van Bestuur is verantwoordelijk voor de dagelijkse gang van zaken en beleidsvorming van Waardeburgh. Zij wordt hierin ondersteund door een managementteam.
De Raad van Bestuur maakt in zijn werk gebruik van diverse adviesraden binnen de organisatie, zoals de ondernemingsraad, de cliëntenraden en de identiteitscommissies.